Vilniaus Prano Mašioto pradinėje mokykloje nuo 2005-2006 m. m. komplektuojama 16 klasių. Organizuojamos pailgintos darbo dienos grupės. Įstaigoje sudarytos palankios sąlygos neformaliam ugdymui, veikia biblioteka. Mokykloje vyksta ankstyvasis anglų kalbos ugdymas nuo antros klasės. Vilniaus Prano Mašioto pradinė mokykla bendradarbiauja su Žirmūnų seniūnija, Policijos nuovada, Planetariumu, Lietuvos nacionaliniu muziejumi, Radvilų rūmais, Vilniaus kolegija, Lietuvos edukologijos universitetu, „Jūratės manufaktūra“ ir kt.
Mokykloje dirba 27 pedagogai, logopedas, psichologas, spec. pedagogas. Teikiama pagalba specialiųjų poreikių mokiniams. Mokyklos mokytojai savo veiklos patirtimi ir pasiekimais, metodinėmis rekomendacijomis dalijasi su užsienio, šalies, Vilniaus miesto švietimo įstaigomis (paskaitos, seminarai, atviros veiklos, bendri projektai ir kt.).
